1 июня 1989 года на основании приказа отдела здравоохранения исполнительного комитета Вологодского областного совета народных депутатов от 18.05.1989 года №140 в Вологодской областной больнице приказом главного врача №69а было открыто кардиохирургическое отделение. Функции данного отделения на момент открытия были определены приказом МЗ РСФСР от 19.06.1985 года №505 «О мерах по развитию электрокардиостимуляции» — хирургическое лечение сложных нарушений ритма, проводимости сердца и электрокардиостимуляция.
В настоящий момент, в связи с изменением нормативной базы, специализированная, в том числе высокотехнологичная медицинская помощь, оказываемая кардиохирургическим отделением, штаты и оснащение отделения соответствуют правилам деятельности отделения хирургического лечения сложных нарушений ритма сердца и электрокардиостимуляции, приложениями 21, 22, 23, 24 к Порядку оказания медицинской помощи больным с сердечно-сосудистыми заболеваниями, утвержденному приказом МЗ РФ от 15.11.2012 года №918н.
С целью приведения в соответствие наименования отделения его основным функциям структурное подразделение «Кардиохирургическое отделение» c 1 декабря 2019 года переименовывается в «Отделение хирургического лечения сложных нарушений ритма сердца и электрокардиостимуляции» с внесением в штатное расписание БУЗ ВО «ВОКБ» всех необходимых изменений. До 1 ноября 2019 года будет утверждено положение об отделении сложных нарушений ритма и электрокардиостимуляции и должностные инструкции сотрудников.